Mae egwyddor weithredol pwmp dŵr môr yn debyg i egwyddor pwmp dŵr arferol. Mae grym allgyrchol a gynhyrchir gan gylchdroi'r impeller yn gyrru'r hylif o'r canol i ymyl y impeller, gan gynhyrchu pwysau ar yr un pryd i ddanfon yr hylif i'r lleoliad a ddymunir. Mae'r broses benodol fel a ganlyn:
Cylchdro impeller: Wedi'i yrru gan fodur, mae'r impeller yn cylchdroi, ac mae'r llafnau ar y impeller yn gwthio'r hylif.
Cynhyrchu Grym Allgyrchol: Mae'r hylif yng nghanol y impeller yn cynhyrchu grym allgyrchol oherwydd cylchdro'r impeller, gan ei daflu tuag at ymyl y impeller.
Trosglwyddo pwysau: O dan bwysau, mae'r hylif ar ymyl y impeller yn mynd trwy'r bibell ollwng ac yn cael ei ddanfon i'r lleoliad a ddymunir.
Sugno hylif: Pan fydd yr hylif yng nghanol y impeller yn cael ei dynnu i ffwrdd, mae gwactod neu gyflwr gwasgedd isel yn cael ei greu yng nghilfach y impeller. Yna mae hylif yn y tanc sugno yn cael ei orfodi i fewnfa'r impeller o dan bwysau atmosfferig neu hydrolig, gan dynnu i mewn a gollwng hylif yn barhaus.